物流管理信息系统通常包括以下主要模块和功能：

1. 订单管理：处理订单、订单跟踪、订单查询等功能。

2. 库存管理：实时监控和管理库存、库存预警、库存调配等。

3. 采购管理：供应商管理、采购订单管理、采购成本分析等。

4. 仓储管理：仓库布局规划、入库、出库、货物装卸等。

5. 运输管理：路线优化、运输跟踪、运输成本核算等。

6. 配送管理：配送计划、配送路线优化、配送员管理等。

7. 物流跟踪：货物实时跟踪、信息查询、异常处理等。

8. 结算管理：运费结算、供应商结算、成本核算等。

9. 数据分析与报表：生成各类物流报表、业务数据分析、决策支持等功能。

10. 客户关系管理：客户信息管理、客户服务支持、投诉处理等。

以上仅为物流管理信息系统的基本功能，实际系统的模块和功能可能根据企业的具体需求和业务特点进行定制。