一般来说，如果商家是因为要求因自身原因拦截快递的，那么商家需要承担相应付的运费。因为拦截快原来的快递流程被打断并重新安排，导致额外的运费和手续费用，这些费用通常需要由商家承担。但是，如果快递本身有问题，如快递损坏或错发，商户可联系快递公司处理，相应费用可由快递公司或商户承担。具体情况还需根据具体合同和协议确定。