虽然经济全球化和物流作业全球化已成为必然的趋势，但也有一些重大壁垒仍在继续影响着国际物流的发展。其中的三大壁垒是：市场和竞争、金融壁垒以及配送渠道壁垒。全球化物流管理必须要对克服这些壁垒的实际成本与国际贸易的潜在利益之间的关系进行权衡，以期通过成功的国际运作获得最大化的实际利益。现将各壁垒分述如下：
（1）市场和竞争。从认识和实践两方面来说，市场和竞争方面的壁垒包括市场进入限制、信息可得性、定价和关税等。
市场进入限制往往是通过立法或司法实践对进口商品制造壁垒来限制其进入国内市场。例如欧洲实施的当地实际到位制度，该项制度要求以市场为基础的制造工厂和配送设施在还没有进入市场前就须安置完毕；在立法上阻止进入的例子如日本实施当地零售商“投票”制度，以表示是否愿意接收新的零售商，特别是外国零售商进入其市场。
信息的缺乏是全球物流的又一壁垒。除有关市场规模、人口和竞争状况等的信息相当有限外，用于明确进口业务和有关单证方面的信息往往也难以得到协调，这方面的要求通常会因不同的政府甚至特定的情况而异。绝大多数国家的政府要求有关单证在货物装运前必须备齐和处理完毕。在许多情况下，如果单证有瑕疵，货物装运就会延迟或被扣押。显然，正确的单证流程对所有的装运来说都很重要，而对国际运输来说更是重要。
定价是一种与营销有关的壁垒。汇率对商品在国际市场上的价格影响很大，经营德国汽车零件的美国配送商所遭遇的境况就能说明汇率是如何影响物流需求的。美国配送商的通常做法是尽可能晚地订购补充零件，以减少风险和投资。然而，当欧元对美元的比价在上升时，采取低成本战略的厂商就会反过来储备零件，以充分利用有利的汇率。
（2）金融壁垒。全球物流中的金融壁垒产生于预测和机构的基础结构。在任何情况下进行预测都十分不易，在全球环境下预测尤其困难。国内预测面临的挑战是要在顾客趋势、竞争行为和季节性波动的基础上进行单位销售量和销售金额的预测；而在全球环境下，这些预测还必须结合汇率、顾客行为以及复杂的政府政策等。机构的基础结构壁垒产生于在如何协调中间人作业方面的差异，其中包括银行、保险公司、法律顾问和运输承运人等。金融上的不确定因素加上机构上的不确定因素，使得厂商难以规划其产品需求和金融需求，其结果便是，厂商不得不增加存货、增加运输的前置时间，以及增加全球物流作业的金融资源。
（3）配送渠道壁垒。国际物流还要面对诸如基础结构标准化和贸易协定等方面差异而形成的国际物流壁垒。基础结构标准化方面的差异是指运输和材料搬运设备、仓库设施和港口设施以及通信系统的差异。尽管近年来提升了集装箱标准化程度，但在全球运输设备中，如运输工具的尺度、能力、重量和轨道规格等方面依然存在着较大的差异，当其未被标准化时，国际物流的费用和时间势必会增加。
贸易限制壁垒也能影响到国际渠道或配送决策。在国际贸易中，关税和非关税壁垒的应用，在一定程度上，降低了进口量，于是，进口商通常会使用在保税仓库里建立存货的方法，来保证第二年年初放行装运到当地的货物供应。这种策略减少了关税费用，但却增加了物流活动的复杂性及其成本。