商家可以通过以下方式来批量查询快递公司：
1. 使用快递公司的官方网站或者官方应用程序提供的批量查询功能，一次性输入多个快递单号，进行查询。
2. 使用第三方物流跟踪平台，如快递鸟，平台提供了批量查询功能，商家可以直接上传多个快递单号进行查询。
3. 通过与快递公司签订的物流合作协议，商家可以获得API接口，通过接口方式实现批量查询快递信息。